广东和浙江的独立是袁世凯取消帝制后讨袁阵营方面所获之重要成果。陆荣廷宣布广西独立后，为了保证广西的安全，并向广东扩张自己的势力，一直在考虑如何将广东将军龙济光拉入讨袁阵营。他一方面利用在自己手中的龙觐光劝说其兄龙济光，一方面摆出如果广东不从则难免一战的态势。已经宣布独立的滇、黔两省主事者唐继尧和刘显世，讨袁阵营的“军师”梁启超，以及龙济光任前清广西提督时的上司、前清两广总督岑春煊等，也在努力说动龙济光加入讨袁。龙济光本非北洋出身，因效忠袁世凯而受重用，但这种效忠并非一成不变，随着袁绝对威权地位的下降，龙济光对袁的效忠也在变化，何况中华革命党在广东发动的讨袁起义也在威胁着龙济光的地位，3月底潮汕驻军已宣布独立。龙济光于内外交困中，被迫于4月6日宣布广东独立，并自任都督。
继广东之后，浙江亦实行独立。革命党人在浙江军队中颇有势力，袁世凯称帝之后，革命党人在浙江军队中积极活动反袁，浙军中的理想正义之士亦起而呼应，形成了浙军中的反袁潮流。1916年4月12日，王文庆等运动浙军起义，浙江将军朱瑞望风而逃，巡按使屈映光在军、绅、商各界的推举下，以兼浙军总司令名义下令维持秩序，但并未正式宣布独立。袁世凯因于14日加屈映光将军衔兼署督理浙江军务。浙军中的革命党人对此种维持秩序的“独立”颇为不满，5月6日推出嘉湖镇守使吕公望为浙江都督，浙江正式宣布独立。粤、浙先后宣布独立，讨袁阵营的势力范围自西南一隅向华南、东南重地扩展，袁世凯的日子更难过了。