和南朝一样，北朝在实行中正制度时，也非常重视门第。北魏孝文帝曾说：“清浊同流，混齐一等，君子小人名品无别，此殊为不可。”[76]当时不仅品选人才看门第，就是各郡所立的乡学，学生入学的资格也要先从高门子弟选起，次及中等。正如赵翼《陔余丛考·六朝重氏族》所说：“当时风尚，右豪宗而贱寒畯，南北皆然，牢不可破。”
九品中正制发展到南北朝后期，弊病日益明显。北魏宣武帝就曾指出，这种选举办法出不了优秀人才。他在正始二年（505年）下诏曰：“中正所铨，但存门第，吏部彝伦，仍不才举。遂使英德罕升，司务多滞。……必令才学并申，资望兼致。”[77]后来，宣武帝索性下令取消州郡中正，任官改由五人保举。魏孝明帝时，吏部尚书崔亮改行“停年格”法，论资排辈取士。不论贤愚，轮流做官，以停职年限多寡依序而行。到后来发展成选士只看年资，不问其他。九品中正制在北朝已走向穷途末路。南朝的情况比此更甚。由于士人的地位优于北方，选举制度极为败坏，已到了非改革不可的地步。梁武帝用州重、郡崇、乡豪代替大小中正，并以“唯才是务”部分取代了门选，说明九品中正制基本已被革除。陈霸先一度恢复此制，只不过是拉拢士族、为篡国而行的权宜之策。
